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Nantes

20 sept 2018

8e Journée scientifique de Biogenouest

Journée scientifique de Biogenouest : Le vivant en images

Les Axes "Bio-imagerie" et "Analyse Structurale et Métabolomique" de Biogenouest, dont l'Inra est membre, organisent une journée d'animation scientifique sur "Le vivant en image".

Mis à jour le 17/09/2018
Publié le 07/09/2018
Mots-clés :

Différents intervenants des plateformes du centre Inra Pays de la Loire interviendront lors de cette journée, notamment :

  • Angélina D’ORLANDO, plateforme BIBS : Couplage AFM/spectroscopie Raman appliqué aux objets biologiques
  • Laurence DUBREIL, plateforme APEX : Optical Clearing and Multiphotonic Microscopy for 3D investigation of whole label-free organ
  • Tristan BOUREAU, plateforme PHENOTIC : Hierarchical clustering based on the combination of chlorophyll fluorescence parameters for the discrimination of biotic stresses displaying similar phenotypes on leaves
  • David LEGLAND, plateforme BIBS : Cartographies paramétriques de la morphologie cellulaire pour la fusion de données en histologie végétale
  • Hélène ROGNIAUX, plateforme BIBS : La spectrométrie de masse : une nouvelle modalité d'imagerie combinant informations chimique et spatiale. Principes de fonctionnement, applications, état de l'art. Présentation de l'offre dans Biogenouest
  • Guillaume LEBRETON, plateforme PHENOTIC : ZIF/PHIS : système d'information pour la gestion de données de phénotypage

Programme :

Session 1. Modalités d'imagerie
10:00 « Imagerie par micro-spectroscopie Raman en Biologie » par Alain FAUTREL, plate-forme H2P2, Rennes
10:20 « Couplage AFM/spectroscopie Raman appliqué aux objets biologiques » par Angélina D’ORLANDO, plate-forme BIBS, Nantes
10:40 « Reconstruction 3D en cryo-microscopie électronique » par Emmanuel GIUDICE, UMR 6290 IGDR, Rennes
11:00 « Optical Clearing and Multiphotonic Microscopy for 3D investigation of whole label-free organ » par Laurence DUBREIL, plate-forme APEX, Nantes
11:20 « Tout est bon dans le proton. Approches in vivo de la Résonance Magnétique » par Pierre-Antoine ELIAT, plate-forme PRISM, Rennes
11:40 « Le micropatterning pour faciliter la multimodalité en imagerie cellulaire »par Voahangy RAKOTONIAINA, plate-forme MicroPICell, Nantes
12:00 « Centre CIMA : la multimodalié au service de l’imagerie de petit animal »
12:30 Buffet repas
Session 2. Analyses de données
14:00 « Médiation chimique microbienne en environnement marin – Quand un champignon rencontre une micro-algue ! » par Samuel BERTRAND, plate-forme Corsaire-ThalassOMICS, Nantes
14:20 « TEP-Scan images from cancer tissue can tell us about the underlying transcriptomic activity » par Laurent CORCOS, plate-forme Corsaire-UBO/Inserm, Brest
14:40 « Hierarchical clustering based on the combination of chlorophyll fluorescence parameters for the discrimination of biotic stresses displaying similar phenotypes on leaves » par Tristan BOUREAU, plate-forme PHENOTIC, Angers
15:00 « Vision par ordinateur pour la microscopie corrélative : optimisation des protocoles d'acquisition grâce aux algorithmes de fusion de données » par Perrine PAUL-GILLOTEAUX, plate-forme MicroPICell, Nantes
15:20 « Cartographies paramétriques de la morphologie cellulaire pour la fusion de données en histologie végétale » par David LEGLAND, plate-forme BIBS, Nantes
15:40 Tables rondes, prospectives
 

-     « Métabolomique spatiale des réponses à l’infection par un champignon pathogène chez le colza » par Anne LEVREL, UMR IGEPP, Le Rheu

-     « Présentation des actions COST Neubias (European network of bio image Analyst) et COMULIS (Correlated Multimodal Imaging in Life Science) » par Perrine PAUL-GILLOTEAUX, plate-forme MicroPICell, Nantes

-     « La spectrométrie de masse : une nouvelle modalité d'imagerie combinant informations chimique et spatiale. Principes de fonctionnement, applications, état de l'art. Présentation de l'offre dans Biogenouest » par Hélène ROGNIAUX, plate-forme BIBS, Nantes

-     « Imagerie polarimétrique par brisure d’orthogonalité appliquée à l'étude de la dynamique de l'architecture intracellulaire » par Marc TRAMIER, plate-forme MRic, Rennes

-     « ZIF/PHIS : système d'information pour la gestion de données de phénotypage » par Guillaume LEBRETON, plate-forme PHENOTIC, Angers

16 :30 Conclusion

Inscription et programme complet sur : https://www.biogenouest.org/agenda/evenement/journee-scientifique-le-vivant-en-images

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Centre(s) associé(s) :
Pays de la Loire